OpenAI為研究長(zhǎng)壽推出GPT-4b，聯(lián)手清華大牛丁勝搞“細(xì)胞重編程”，奧特曼本人投資

夢(mèng)晨 2025-01-20 09:11:01 來(lái)源：量子位

夢(mèng)晨 西風(fēng) 發(fā)自 凹非寺
量子位 | 公眾號(hào) QbitAI

OpenAI要研究人類長(zhǎng)壽問(wèn)題了？？推出新模型GPT-4b micro。

可以設(shè)計(jì)出將普通細(xì)胞轉(zhuǎn)化為干細(xì)胞的蛋白質(zhì)。

據(jù)MIT科技評(píng)論消息，這是OpenAI首個(gè)專注于生物數(shù)據(jù)的大模型，也是OpenAI首次公開(kāi)聲稱其模型可以帶來(lái)意想不到的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。

研究合作方Retro Biosciences，一家成立于2022年的創(chuàng)業(yè)公司，專注于“抵抗細(xì)胞衰老的新藥開(kāi)發(fā)”，包括細(xì)胞重編程、自噬和受血漿啟發(fā)的療法。

聯(lián)合創(chuàng)始人丁勝，為清華藥學(xué)院創(chuàng)始院長(zhǎng)（于2022年6月卸任院長(zhǎng)，仍繼續(xù)在藥學(xué)院任教并從事研究工作）。

丁勝教授團(tuán)隊(duì)首次以化學(xué)小分子組合體外定向誘導(dǎo)小鼠全能干細(xì)胞并穩(wěn)定培養(yǎng)，成果在2022年登上Nature。

另一位聯(lián)合創(chuàng)始人Joe Betts-LaCroix，在加州理工期間首次闡明了蛋白質(zhì)中電子隧道速率的控制因素，成果登上Science，Joe還在YC擔(dān)任過(guò)2.5年的兼職合伙人（伏筆），指導(dǎo)和投資了眾多生物初創(chuàng)公司。

2022年4月，Retro Biosciences對(duì)外披露已獲得1.8億美元融資，但對(duì)投資人身份守口如瓶。

直到ChatGPT推出之后，2023年3月世界才知道，這位神秘投資人正是OpenAI CEO奧特曼本曼。

Retro Bioscience也開(kāi)始被稱為“抗衰界的OpenAI”。

要為人類延壽10年

Retro的目標(biāo)是將人類的正常壽命延長(zhǎng)10年。

Retro與OpenAI正式合作開(kāi)始于一年前，他們研究的重點(diǎn)是山中因子（Yamanaka factors），由諾獎(jiǎng)得主山中伸彌在2006年提出。

山中因子是一組蛋白質(zhì)，可以將人類皮膚細(xì)胞轉(zhuǎn)化為看起來(lái)更年輕的干細(xì)胞。不過(guò)，這種細(xì)胞“重編程”效率并不高，需要數(shù)周時(shí)間，且經(jīng)實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)皿處理的細(xì)胞中不到1%能完成再生。

為此，OpenAI開(kāi)發(fā)了名為GPT-4b micro的新模型，用于提出改進(jìn)蛋白質(zhì)因子功能的方法。

OpenAI用大量物種的蛋白質(zhì)序列實(shí)例以及蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)信息訓(xùn)練了GPT-4b micro。

其工作方式與谷歌的AlphaFold大不相同，AlphaFold用于預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，山中因子則是一類異常松散且無(wú)固定結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)。

Retro的科學(xué)家嘗試引導(dǎo)模型生成可能的山中蛋白質(zhì)重新設(shè)計(jì)方案，使用的是類似于“few-shot”的提示，即用一系列帶有答案的示例作為上下文提示，隨后添加一個(gè)需要模型生成答案的新示例。

盡管基因工程師可以在實(shí)驗(yàn)室中通過(guò)一定的方法引導(dǎo)分子進(jìn)化，但受限于實(shí)驗(yàn)條件，他們通常只能測(cè)試有限的可能性，但對(duì)于典型長(zhǎng)度的蛋白質(zhì)來(lái)說(shuō)，其改造方式幾乎是無(wú)限的。

OpenAI的模型卻能經(jīng)常生成含顯著改動(dòng)的設(shè)計(jì)建議，其中三分之一的蛋白質(zhì)氨基酸被改變。

Retro CEO Joe Betts-Lacroix指出，該模型提出的建議很好：

我們立即將這個(gè)模型應(yīng)用到了實(shí)驗(yàn)室，并得到了實(shí)際的成果。

OpenAI也介紹道，研究人員根據(jù)模型的建議對(duì)兩個(gè)山中因子進(jìn)行了改造，根據(jù)初步測(cè)量結(jié)果，其效果提升了50倍以上。

OpenAI研究員John Hallman、Aaron Jaech和Retro的Rico Meinl是該模型的開(kāi)發(fā)負(fù)責(zé)人。

John Hallman表示：

從整體來(lái)看，這些蛋白質(zhì)的性能似乎比科學(xué)家自己設(shè)計(jì)的要好得多。

不過(guò)，在研究結(jié)果發(fā)表之前，外界科學(xué)家無(wú)法驗(yàn)證這些結(jié)果的真實(shí)性。并且該模型目前也未對(duì)外開(kāi)放使用，目前只有一個(gè)定制化的展示案例。GPT-4b micro是如何得出這些猜測(cè)的，也仍然不清楚。

關(guān)于模型的未來(lái)走向，Aaron Jaech表示是否單獨(dú)發(fā)布或整合到OpenAI主流推理模型中，尚未確定。

值得一提的是，OpenAI還特別強(qiáng)調(diào)，Altman并未直接參與這項(xiàng)工作，且公司從未根據(jù)Altman的其他投資作出決策。

參考鏈接：https://www.technologyreview.com/2025/01/17/1110086/openai-has-created-an-ai-model-for-longevity-science/