AlphaFold再立功！30天發(fā)現(xiàn)CDK20小分子抑制劑，有望成為肝細(xì)胞癌創(chuàng)新療法
來自英矽智能團(tuán)隊(duì)
AlphaFold計(jì)算機(jī)程序預(yù)測(cè)了整個(gè)人類基因組的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，被認(rèn)為是人工智能應(yīng)用于結(jié)構(gòu)生物學(xué)的顯著突破。
盡管置信度不同，這些預(yù)測(cè)的結(jié)構(gòu)仍然可以大大促進(jìn)基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)(SBDD)，特別是對(duì)于那些沒有可用的蛋白結(jié)構(gòu)信息或蛋白結(jié)構(gòu)信息有限的新靶點(diǎn)。
最近，就有研究團(tuán)隊(duì)將AlphaFold應(yīng)用于端到端人工智能藥物發(fā)現(xiàn)引擎中，該引擎由一個(gè)生物計(jì)算平臺(tái)PandaOmics 和生成化學(xué)平臺(tái)Chemistry42組成。
團(tuán)隊(duì)在30天內(nèi)完成靶點(diǎn)選擇、分子生成、化合物合成和生物學(xué)測(cè)試。
最終在僅合成測(cè)試了7個(gè)化合物的情況下，就確定了一個(gè)針對(duì)CDK20的小分子抑制劑，并預(yù)測(cè)了結(jié)合模式。
CDK20，又稱細(xì)胞周期相關(guān)激酶(CCRK)，是細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶家族中最新發(fā)現(xiàn)的成員，由于其細(xì)胞周期依賴性和非依賴性功能(腫瘤微環(huán)境免疫抑制)，近年來引起廣泛關(guān)注。
越來越多的證據(jù)表明，CDK20在許多腫瘤細(xì)胞株中過度表達(dá)，在不同類型癌癥患者的腫瘤樣本中高表達(dá)，例如結(jié)直腸癌、肝細(xì)胞癌、肺癌和卵巢癌。
因此，CDK20抑制劑有望成為癌癥，特別是肝細(xì)胞癌的創(chuàng)新療法。
論文鏈接：
https://arxiv.org/abs/2201.09647
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